BioSTM a été créée le 1er janvier 2019. BioSTM est labellisée CNRS UMS 3612 et Inserm US25, et son établissement de rattachement est l’Université Paris Cité.
Depuis le 1er janvier 2025, BioSTM est intégrée aux Plateformes Mutualisées de l’Institut du Médicament (P-MIM), au sein de l’Institut Pharmacie, Sciences et Santé (IP2S).